Standardisierte Terminologien in der Medizin - Köln 3.6.2005 1
Die Referenzterminologie
"SNOMED CT"und ihre Anwendungen
Prof. em. Dr. Joachim DudeckPD. Dr. Simon Hölzer, Dr. Ralf Schweiger
Institut für Medizinische Informatik Giessen H+ Bern
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Referenzterminologie SNOMED CTInteroperabilität
– Fähigkeit von Komponenten oder Systemen, ohne
Eingreifen des Menschen
• Informationen auszutauschen (Funktionelle Interoperabilität)
• ausgetauschte Informationen direkt zu verwenden
und weiter zu verarbeiten (Semantische Interoperabilität)
– Verlangt Standardisierung der Nachrichten bzw.
Dokumentstrukturen und der Terminologien
– Ziel - Plug-and Play Funktionalität
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Referenzterminologie SNOMED CTTerminologien - Vokabulare
– Klassifikationssysteme
• Fassen ähnliche Objekte in Klassen zusammen
• Mit Notationen entstehen Klassifikationsschlüsel (ICD10, ICPM)
• Informationsverlust
– Nomenklaturen, Thesauri, Terminologien
• Geben jedem eigenständigen Objekt eine Bezeichnung
• Mit Notationen entstehen Identifikationsschlüssel (LOINC, SNOMED CT)
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Referenzterminologie SNOMED CTNomenklaturen - Klassifikationen
Ordnungssystem
Nomenklatur Klassifikationssystem
Notationeineindeutig
Notationeindeutig
Identifikations-schlüssel (LOINC)
Klassifikations-schlüssel (ICD10)
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Referenzterminologie SNOMED CTNomenklaturen - Klassifikationen
SNOMED CT14532008
6296006253740007966000455650084266600053189005
Klassifikation
Nomenklatur
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Referenzterminologie SNOMED CTSNOMED
• SNOMED - Systematized Nomenclature of Medicine
– Beschreibung der Medizinischen Objekte über 7 (9) Achsen
– Anwendung vorwiegend über Postkoordination(Objekten werden Codes aus den einzelnen Achsen zugeordnet)
– Anwendung aufwändig
– Praktisch keine Akzeptanz
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Referenzterminologie SNOMED CTSNOMED
Bezeichnung der Achsen• T - Topographie - Lokalisation
• M - Morphologie - Histologie 8000 - 9999 Morphologie maligner Tumoren (ICD-O)
• E - Ätiologie - Ursache
– C - Medikamente
– L - Lebende Organismen
– A - Physische Agentien, Kräfte
• F - Funktionsstörung
• D - Diagnose
• P - Prozeduren
• J - berufliche Belastungen
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Referenzterminologie SNOMED CTPostkoordination - Praekoordination
• Beispiel für Postkoordination (nach Leiner)
Ein Schiffskoch "J53150" wird mit den Symptomen Fieber "F03003", Schüttelfrost "F03260" und Diarrhoe "F62400" als Notfall in ein Krankenhaus aufgenommen "P00300". Dort wird eine akute Entzündung "M41000" des Magens "T63000" und des Duodenums "T64300" hervorgerufen durch Salmonella cholerae-suis "E16010" diagnostiziert und die Diagnose Gastroenteritis paratyphosa "D01550" gestellt
– PraekoordinationGastroenteritis paratyphosa durch Salmonella cholerae-suis 42338000 80232006
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LOINC - Totale Praekoordination
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Referenzterminologie SNOMED CTSNOMED CT
• SNOMED CT - Clinical Terms
– Umfassende klinische Terminologie zur Codierung von
• Erkrankungen
• Befunden
• Verfahren
• Medikationen
• Ursachen von Erkrankungen
– Entstanden aus SNOMED RT und Readcode Version 3
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Referenzterminologie SNOMED CTSNOMED CT
• SNOMED CT - Clinical Terms
– Jeder eigenständige Medizinische Begriff wird als Konzept (Clinical Term) definiert (Praekoordination)
– Konzepte gehören verschiedenen SNOMED CT Hierarchien (Achsen) an (Disease, Finding Site, Procedure, Morphology ..)
– Zwischen Konzepten werden Beziehungen definiert
– Jedes Konzept erhält eine numerische Bezeichnung als Konzeptidentifikation
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Referenzterminologie SNOMED CTDrei "Core" Tabellen
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Referenzterminologie SNOMED CTDrei "Core" Tabellen
• SNOMED CT - Clinical Terms
– Jedem Konzept werden in der "Concept Table" zugeordnet
• Fully specified Name - eindeutige Konzeptbezeichnung zur internen Zuordnung zu den Hierarchien
• Konzeptstatus (aktuell, überholt, etc.)
• Primitive Flag
Aus historischen Gründen
• SNOMED RT Bezeichnung
• Read Code Bezeichnung
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Referenzterminologie SNOMED CTDrei "Core" Tabellen
• SNOMED CT - Clinical Terms
– Jedem Konzept werden in der "Description Table" zugeordnet
• mindestens ein Eintrag als "Preferred Term"
• beliebige Zahl von Synonymen
– Konzepte können über die "Relationship Table " miteinander verbunden werden
• Relationshiptyp enthält Attribut Konzept zur Beschreibung der Beziehung
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Referenzterminologie SNOMED CTSemantisches Netz
• SNOMED CT Konzepte
– sind auf unterschiedlichen Granularitätsstufen definiert
– über polyhierarchische Beziehungen verbunden
– Bilden ein umfassendes semantisches Netz
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Referenzterminologie SNOMED CTPolyhierarchien
has-finding-site endocardium
has-causative-agentStaphylococcus hylcus
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Referenzterminologie SNOMED CT Notation
Struktur der Notation
– Item IDeigentliche Konzept ID
– Namespace IDnur verwendet beilokalen Entwicklungen
– Partition ID00 - Concepts01 - Descriptions02 - Relationships Check-digit - Prüfziffer03 - Subsets für spezielle Anwendungen
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Referenzterminologie SNOMED CT
Preferred Term
Synonyme
SNOMED CT Konzepte und deren Beschreibungen
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SNOMED CT - Achsen (Hierarchien)
Konzepte werden einer
von 18verschiedenen
Achsenzugeordnet
3 Hauptachsen15 unterstützende
Achsen
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Referenzterminologie SNOMED CTBeziehungen zwischen Konzepten
• Mehrere Beziehungstypen sind definiert
– Hierarchische Beziehungen innerhalb einer Achse
• Is-a
• Is-part-of
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Referenzterminologie SNOMED CTBeziehungen zwischen Konzepten
• Attribut Beziehungen (Linkage Concepts Hierarchies)
– Definiert zwischen Konzepten in verschiedenen Hierarchien (Achsen)
– Zulässige Attribute achsenabhängig
– Erlauben Postkoordination
– Unterstützen vor allem Retrieval Funktionen
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Referenzterminologie SNOMED CTAttribute der Disease Achse
Krankheiten
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Referenzterminologie SNOMED CTAttribute der Procedure Achse
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Referenzterminologie SNOMED CTAttribute der Kontext Achse
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SNOMED CTMapping anderer Terminologien
Bereits integriert
• NANDA
• LOINC
• ICD9 / ICD10
• Britische Arzneimittelklassifikation
• Osteopathic Medical Terminology
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UK NHS Arzneimittel Modell
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SNOMED CT Verbesserungen Juli 2005
– Elimination von doppelten, redundanten und ungenügend spezifizierten ("ambiguous") Konzepten
– Attribute durch "Linking Concept Hierarchy" ersetzt - Struktur verbessert
– Arzneimittel und Medizinische Produkte weiter verfeinert
• Abbildung des NHS Modells
• Attribut "has_dose_form" eingeführt
– Ergänzung durch "adverse anaesthesia outcome" Konzepte
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SNOMED CTInternationale Anwendungen
• USA - empfohlen durch NCVHS
• NHS UK, Niederlande, Dänemark
• Südkorea, Taiwan, Japan
• Mexiko, Argentinien, Spanien
• CERNER 5 Jahreskontrakt zur weltweiten
Verbreitung
• Beschaffung für Europa empfohlen
• Internationale Lizenzen
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SNOMED CT Übersetzungen
SNOMED CT
– Übersetzungen sind derzeit verfügbar
• Spanisch
• Deutsch
– Evaluierung der Deutsche Übersetzung vorgesehen
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SNOMED CT Deutsche Übersetzung
• Erfahrungen
– Konzeptbezeichnungen (Fully specified names) und Preferred Terms müssen vollständig übersetzt werden
– Weitgehend erfolgreich erreicht
– Synonyme können nur partiell übersetzt werden (Ziegenpeter)
– In jeder Sprache neue Synonymen notwendig - Vergabe von Description ID's
– Ausführliche Validierung notwendig
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SNOMED CT Verfügbare Tools
Clue Browser
– Entwickelt von David Markwell UK
– Verfügbar als Freeware wenn SNOMED CT Lizenz vorhanden
– Leichtes Navigieren im SNOMED CT Netzwerk
– Für klinische Anwendungen nicht geeignet
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SNOMED CT Verfügbare Tools
LuMriX SNOMED CT Tool
– Entwickelt von Ralf Schweiger als LuMriX Anwendung
– In der praktischen Erprobung
– Konzipiert als Web Anwendung
– Multilinguale Anwendung
amerikanische Version
deutsche Version
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Entwicklungsstand von SNOMED CTInternationale Anwendungen
• LuMriX - SNOMED CT
• Zunächst werden die dem Suchbegriff entsprechenden SNOMED CT Konzepte gezeigt
• Durch Anklicken werden hierarchische und attributive Beziehungen aufgezeigt
+
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Entwicklungsstand von SNOMED CTInternationale Anwendungen
Übergeordnete Hierarchie
Nachgeordnete Hierarchie
Anklicken der Icon führt zur deutschen Version
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Entwicklungsstand von SNOMED CTInternationale Anwendungen
+
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Entwicklungsstand von SNOMED CTInternationale Anwendungen
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Entwicklungsstand von SNOMED CTInternationale Anwendungen
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Entwicklungsstand von SNOMED CTEingabe neuer Synonyme
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Entwicklungsstand von SNOMED CTEingabe von Kommentaren
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SNOMED CTAnwendungen
– Klinische Anwendungen noch sehr gering
– EHR erfordert exakte Beschreibung des
Krankheitsbildes
– Verlangt feinere Granulierung und bessere
Vernetzung als ICD10
– Internationale Standard Terminologie notwendig
– SNOMED CT erfüllt Anforderungen
– Richtungsentscheidung notwendig
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SNOMED CTAlpha-ID
– Ad-hoc Zuordnung einer numerischen Notation zu
Inhalten des ICD10 Thesaurus
– Inhaltliche Vernetzung nur über ICD10
– Keine Differenzierung zwischen feiner granulierten
Konzepten und Synonymen
– Keine internationale Äquivalenz
– Einfügen in SNOMED CT - Synonym Katalog
erweitern
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SNOMED CTAlpha-ID
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NomenklaturenAlpha-ID - SNOMED CT
SNOMED CT14532008
6296006253740007966000455650084266600053189005
Alpha-ID Codes sind praktisch vollständig in SNOMED CT verfügbarEinführung auf nationaler Ebene sinnvoll ?
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SNOMED CTStatus
– Umfassendste, derzeit verfügbare medizinische
Terminologie
– Internationales Interesse nimmt zu
– Übergang zu einer offeneren Politik durch SNOMED
International
– Klärung der internationalen Lizenzfragen notwendig
– Klinisch-orientiertes Interface erforderlich
– Könnte weltweit akzeptierte Standard Terminologie
werden